欧洲分子生物学实验室的分站EBI开发的压缩比对文件格式；存储从短读比对器（如BWA、BBMap和BLAT）生成的短DNA序列读取比对。

.CRAM 文件格式类似于二进制对齐/映射（BAM）文件格式，但具有更好的文件压缩和重新构造的面向列的二进制容器格式。随着遗传软件领域数据量的增加，.CRAM 格式被设计成减少校准数据的磁盘脚印。 短读比对是破译基因组中序列来源的过程。这可能很困难，因为参考基因组相当大，你并不总是在参考基因组中寻找精确的匹配。短读对齐器用于搜索大量序列中的匹配项和接近匹配项。由于序列太大，所以像.CRAM 这样的格式提供的压缩对于保持文件大小的可管理性是必要的。